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內容簡介: |
《本草基因组学》教材第1版于2018年出版,受到学术界和大专院校的广泛关注。《本草基因组学》在对第1版进行修订的基础上对本草基因组学近年研究进行了跟进和总结,加强了概念性和理论性的介绍,并对未来的研究思路和方向进行了思考和探讨。《本草基因组学》第一章至第九章为前半部分,第十章至第十八章为后半部分。前半部分包括绪论、结构基因组学、功能基因组学、表观基因组学和宏基因组学等,论述了本草基因组学的核心研究内容。后半部分包括药用模式生物、中药合成生物学、基因组辅助育种、DNA鉴定、中药体内过程组学研究、关键实验技术、生物信息学及数据库等内容,重点论述本草基因组学的主要应用,并引入了药用植物系统基因组、表型组、人工智能等前沿内容。
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目錄:
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目录第一章 绪论 1第一节 本草基因组学的产生和发展 1第二节 本草基因组学研究内容 7第三节 本草基因组学的应用 23第二章 药用生物结构基因组 26第一节 药用生物核基因组概述 26第二节 药用植物基因组 30第三节 药用动物与药用真菌基因组 43第三章 药用生物细胞器基因组 53第一节 药用植物叶绿体基因组 53第二节 药用生物线粒体基因组 64第四章 药用生物转录组研究 70第一节 转录组概述 70第二节 RNA-seq转录组研究 71第三节 全长转录组研究 77第四节 单细胞转录组研究 86第五节 空间转录组研究 97第五章 药用生物蛋白质组研究 106第一节 蛋白质组学概述 106第二节 药用植物蛋白质组 110第三节 药用动物蛋白质组 117第六章 药用植物代谢组学研究 121第一节 药用植物代谢组学研究策略 121第二节 基于代谢组学的中药鉴定和质量评价 126第三节 基于代谢组学的天然产物合成研究 132第七章 天然产物生物合成途径解析 139第一节 天然产物生物合成途径研究策略 140第二节 萜类生物合成途径 143第三节 生物碱类生物合成途径 153第四节 苯丙素类生物合成途径 159第八章 表观基因组学 163第一节 表观基因组研究策略 163第二节 非编码RNA 168第三节 DNA甲基化 173第四节 染色质三维结构 178第九章 药用植物宏基因组学 183第一节 药用植物宏基因组学研究策略 183第二节 药用植物根际微生物宏基因组 187第三节 药用植物内生菌宏基因组 198第十章 药用模式生物研究 205第一节 药用模式生物研究策略 206第二节 药用模式真菌——灵芝 212第三节 药用模式植物——丹参 218第四节 其他相关模式生物 226第十一章 中药合成生物学研究 232第一节 中药合成生物学体系创建 233第二节 中药合成生物学体系优化策略 235第三节 萜类合成生物学 240第四节 生物碱合成生物学 245第五节 黄酮合成生物学 248第十二章 药用植物分子育种研究 254第一节 药用植物分子育种原理与方法 254第二节 优质适产药用植物分子育种 258第三节 抗逆药用植物分子育种 267第十三章 中药分子鉴定 272第一节 DNA条形码鉴定 272第二节 超级条形码鉴定 281第三节 其他分子鉴定技术 285第十四章 中药药物体内过程组学研究 290第一节 中药药物代谢组学 290第二节 中药肠道宏基因组学 295第三节 中药药物基因组学 302第四节 中药药物蛋白质组学 308第十五章 本草基因组学关键实验技术 315第一节 结构基因组学关键技术 315第二节 转录组学关键技术 320第三节 功能基因组研究关键技术 320第四节 蛋白质组学关键技术 323第五节 代谢组学关键技术 325第六节 合成生物学关键技术 327第十六章 生物信息学及数据库 330第一节 生物信息学编程基础 330第二节 生物信息学常用分析方法 333第三节 基因组相关数据库 337第四节 生物信息学中的人工智能 343第十七章 药用生物系统基因组学 349第一节 系统基因组学基本概念 349第二节 药用生物系统基因组学研究与应用 352第三节 研究的问题与发展方向 355第十八章 表型组学 358第一节 植物表型组学的研究内容 358第二节 植物表型组研究方法 361第三节 中药植物表型组研究方法 363重要参考文献 367
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