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| 內容簡介： |
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本书的研究基于木奶果全基因组测序，分析其基因家族和基因组复制事件等，通过挖掘相关基因的功能，为木奶果引种、驯化及选育提供遗传学基础。同时，结合果肉不同发育阶段代谢组和转录组数据，分析不同果肉颜色中基因表达的差异，筛选影响木奶果果肉颜色形成和糖、酸代谢途径的关键基因，并利用qRT-PCR技术对关键基因的表达式样进行验证，阐述果肉在不同发育期可溶性糖和有机酸的代谢途径及相关差异表达基因，揭示木奶果果肉中的类黄酮、花色苷合成途径，明确产生色差的内在原因。木奶果果肉性状的研究，能揭示不同木奶果地方品系口味差异的原因，促进对木奶果果实的开发利用，从而加快木奶果的品种选育和栽培推广，为木奶果种质资源多样性保护及开发利用提供重要的基础支撑。
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| 目錄：
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第1章 木奶果概述
1.1 木奶果的生物学特性
1.2 木奶果的应用价值
第2章 木奶果的植物群落特征
2.1 植物群落特征研究进展
2.1.1 植物群落的研究内容
2.1.2 亚热带森林不同演替阶段的群落特征变化
2.2 群落野外调查
2.2.1 群落调查点概况
2.2.2 群落调查方法
2.3 木奶果群落现状
2.3.1 群落物种组成与区系分析
2.3.2 群落结构特征
2.4 木奶果群落特征
2.4.1 群落组成与区系分析
2.4.2 不同龄组木奶果阴生与阳生特征分析
2.4.3 群落结构与演替分析
2.4.4 木奶果在不同年龄段的阴生与阳生特征分析
第3章 木奶果的栽培技术
3.1 木奶果的繁殖
3.1.1 种子繁殖
3.1.2 轩插繁殖
3.1.3 高压繁殖
3.1.4 嫁接繁殖
3.2 植物光适应性研究的意义
3.2.1 遮阴对植物生长的影响
3.2.2 遮阴对植物生理特性的影响
3.3 木奶果的幼苗栽培技术
3.3.1 试验地概况
3.3.2 试验材料
3.3.3 试验方法
3.3.4 指标测定的方法
3.3.5 木奶果幼苗的光适应性响应
3.3.6 木奶果幼苗的栽培关键技术
第4章 木奶果的基因组
4.1 基因组学对果实性状研究的意义
4.2 木奶果基因组测序
4.2.1 DNA提取及文库构建
4.2.2 数据过滤及质控
4.2.3 RNA提取及建库、质检和测序
4.2.4 基因组组装及评估
4.2.5 基因组注释
4.2.6 木奶果基因家族的收缩和扩张及系统进化分析
4.2.7 木奶果全基因组复制事件和共线性分析
4.3 木奶果全基因组测序统计
4.3.1 测序数据统计
4.3.2 基因组评估
4.3.3 基因组组装及质量评估
4.3.4 基因组注释及质量评估
4.4 木奶果的比较基因组
4.4.1 木奶果与近缘种的同源基因比较
4.4.2 系统进化与基因家族扩张收缩分析
4.4.3 全基因组复制及共线性分析
4.5 木奶果全基因组测序分析
4.5.1 木奶果基因组测序评估
4.5.2 木奶果基因组组装
4.5.3 木奶果基因组结构
4.5.4 木奶果比较基因组
第5章 木奶果的果肉品质代谢组学研究
5.1 代谢组学在果品研究中的意义
5.2 木奶果果实发育的代谢组学
5.2.1 材料
5.2.2 样品采集
5.2.3 代谢物提取
5.2.4 UPLC-MS/MS分析
5.2.5 数据质控
5.2.6 MS数据处理及统计分析
5.3 木奶果的果肉代谢组
5.3.1 代谢物数据质控
5.3.2 木奶果果肉主要成分
5.3.3 LR5和BR5成熟期差异代谢物分析
5.3.4 木奶果果肉的主要营养物质及代谢变化
5.3.5 木奶果果实保存期分析
5.3.6 果肉完全成熟期代谢物的KEGG富集
5.4 木奶果果肉主要性状分析
5.4.1 果肉口味关键代谢物
5.4.2 果肉颜色主要成分
5.4.3 木奶果果实保存期
第6章 木奶果的果品调控转录组学研究
6.1 果品主要性状的研究背景
6.1.1 转录组学在果实性状研究中的意义
6.1.2 转录组学和代谢组学在果实性状研究中的意义
6.1.3 类黄酮和花色苷合成途径
6.1.4 可溶性糖和有机酸代谢途径
6.2 木奶果果肉的转录组学
6.2.1 RNA提取及检测
6.2.2 文库构建及测序
6.2.3 木奶果果肉测序数据质控及评估
6.2.4 转录组数据的比对
6.2.5 差异表达基因分析
6.2.6 转录因子分析
6.2.7 qRT-PCR实验
6.3 木奶果果肉转录组分析
6.3.1 木奶果不同发育期果肉样品测序数据评估
6.3.2 基因表达量分析
6.3.3 木奶果果肉发育期DEGs分析
6.3.4 木奶果果肉发育中DEGs的GO功能富集分析
6.3.5 木奶果果实发育中DEGs的KEGG富集分析
6.3.6 木奶果果肉中类黄酮代谢途径中的基因表达式样分析
6.3.7 可溶性糖和有机酸代谢途径基因表达式样分析
6.3.8 转录因子分析
6.3.9 果实发育过程中DEGs的qRT-PCR验证
6.4 木奶果果肉主要性状的差异表达基因
6.4.1 木奶果果实成熟发育过程中DEGs分析
6.4.2 木奶果果肉颜色相关的关键基因
6.4.3 木奶果果肉可溶性糖和有机酸代谢途径的关键基因
第7章 结论与展望
7.1 本书主要结论
7.1.1 木奶果群落和幼苗光适应分析
7.1.2 木奶果基因组分析
7.1.3 木奶果果肉代谢组分析
7.1.4 木奶果果肉转录组分析
7.2 创新点
7.3 展望
7.3.1 木奶果群落和幼苗光适应的研究展望
7.3.2 基于木奶果基因组的果肉颜色和口味形成机制研究展望
参考文献
附录
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