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『簡體書』基于高通量测序的基因组分析

書城自編碼: 3760612
分類:簡體書→大陸圖書→自然科學生物科學
作者: 王峥峰
國際書號(ISBN): 9787030721488
出版社: 科学出版社
出版日期: 2022-06-01

頁數/字數: /
書度/開本: 16开 釘裝: 平装

售價:HK$ 135.0

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內容簡介:
高通量测序已成为生物学研究的重要手段,在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用,因此,如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的必备技能之一。《基于高通量测序的基因组分析》以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例,采用分步讲解的方式,图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式,利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序,程序执行过程及其分析注意事项。同时,对于数据分析运算中的一些中间结果,作者提供了自己编写的程序,以利于获得最终结果。《基于高通量测序的基因组分析》提供了Linux操作系统安装方法,并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程,其中没有复杂的程序代码,不需要编程语言基础,浅显易懂,具有很强的实践操作性。
目錄
目录第一章 Linux系统安装 1第二章 Linux基本命令 6第三章 高通量测序数据的常见格式 12第四章 基因组组装 15第一节 基因组大小估测  15第二节 基于PacBio HiFi模式测序数据的基因组组装 21第三节 基于PacBio CLR模式测序数据的基因组组装 27第四节 基于Nanopore测序数据的基因组组装 30第五节 去除基因组中的冗余序列 37第六节 Hi-C组装 47第五章 重复序列查找 66第六章 基因预测 72第七章 基因家族扩张和收缩  82第八章 物种历史动态 100第九章 群体重测序个体的SNP查找 110第十章 遗传多样性参数计算 124第十一章 受选择作用的SNP位点 129第一节 PCAdapt分析 129第二节 BayPass分析 135第三节 合并PCAdapt和BayPass结果 140第十二章 遗传结构分析 144第一节 PCA分析 144第二节 Admixture分析 146

 

 

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